Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ccdc136Q3TVA9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ccdc136Q3TVA9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc136Q3TVA9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Ccdc136Q3TVA9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Ccdc136Q3TVA9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Ccdc136Q3TVA9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms