Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cwc27Q3TKY6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Cwc27Q3TKY6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Cwc27Q3TKY6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Cwc27Q3TKY6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cwc27Q3TKY6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cwc27Q3TKY6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cwc27Q3TKY6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cwc27Q3TKY6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,4 ms