Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc69Q3TCJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms