Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KncnQ307W7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KncnQ307W7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KncnQ307W7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms