Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox4cQ2MDG1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox4cQ2MDG1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox4cQ2MDG1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4cQ2MDG1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4cQ2MDG1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4cQ2MDG1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4cQ2MDG1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4cQ2MDG1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4cQ2MDG1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4cQ2MDG1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms