Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpusd2Q149F1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpusd2Q149F1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpusd2Q149F1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpusd2Q149F1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms