Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Perm1Q149B8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Perm1Q149B8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Perm1Q149B8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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