Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klrb1Q0ZUP1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrb1Q0ZUP1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Klrb1Q0ZUP1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms