Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtel1Q0VGM9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtel1Q0VGM9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtel1Q0VGM9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtel1Q0VGM9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms