Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Vps8Q0P5W1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Vps8Q0P5W1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33,53■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Vps8Q0P5W1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Vps8Q0P5W1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33,45■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,1 ms