Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cib3Q0P523 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib3Q0P523 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms