Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubxn2bQ0KL01 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubxn2bQ0KL01 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms