Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plac8l1Q08EJ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plac8l1Q08EJ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms