Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700061G19RikQ08EE8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700061G19RikQ08EE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700061G19RikQ08EE8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700061G19RikQ08EE8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms