Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Runx2Q08775 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Runx2Q08775 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Runx2Q08775 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms