Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn2Q08093 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn2Q08093 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms