Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc2Q05020 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoc2Q05020 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc2Q05020 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms