Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mmp11Q02853 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp11Q02853 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp11Q02853 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms