Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col6a2Q02788 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col6a2Q02788 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col6a2Q02788 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms