Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GscQ02591 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GscQ02591 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GscQ02591 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GscQ02591 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GscQ02591 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GscQ02591 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GscQ02591 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GscQ02591 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GscQ02591 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GscQ02591 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GscQ02591 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GscQ02591 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GscQ02591 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GscQ02591 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GscQ02591 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GscQ02591 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GscQ02591 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GscQ02591 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GscQ02591 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GscQ02591 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GscQ02591 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GscQ02591 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GscQ02591 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GscQ02591 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GscQ02591 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GscQ02591 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GscQ02591 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GscQ02591 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GscQ02591 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GscQ02591 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GscQ02591 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GscQ02591 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GscQ02591 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GscQ02591 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GscQ02591 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GscQ02591 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GscQ02591 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GscQ02591 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GscQ02591 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GscQ02591 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GscQ02591 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GscQ02591 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GscQ02591 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GscQ02591 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GscQ02591 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GscQ02591 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GscQ02591 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GscQ02591 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GscQ02591 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GscQ02591 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GscQ02591 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GscQ02591 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GscQ02591 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GscQ02591 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GscQ02591 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GscQ02591 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GscQ02591 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GscQ02591 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GscQ02591 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GscQ02591 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GscQ02591 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GscQ02591 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GscQ02591 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GscQ02591 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GscQ02591 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GscQ02591 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GscQ02591 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GscQ02591 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GscQ02591 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GscQ02591 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GscQ02591 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GscQ02591 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GscQ02591 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GscQ02591 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GscQ02591 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GscQ02591 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GscQ02591 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GscQ02591 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GscQ02591 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GscQ02591 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GscQ02591 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GscQ02591 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GscQ02591 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GscQ02591 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms