Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ank1Q02357 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ank1Q02357 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ank1Q02357 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ank1Q02357 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ank1Q02357 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ank1Q02357 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ank1Q02357 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ank1Q02357 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ank1Q02357 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms