Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mc1rQ01727 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mc1rQ01727 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mc1rQ01727 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mc1rQ01727 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mc1rQ01727 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mc1rQ01727 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mc1rQ01727 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms