Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Col1a2Q01149 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col1a2Q01149 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Col1a2Q01149 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col1a2Q01149 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms