Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GabpaQ00422 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabpaQ00422 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GabpaQ00422 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabpaQ00422 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms