Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scn1bP97952 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn1bP97952 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn1bP97952 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms