Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cited1P97769 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cited1P97769 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cited1P97769 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cited1P97769 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cited1P97769 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cited1P97769 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cited1P97769 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited1P97769 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms