Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TnikP83510 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TnikP83510 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TnikP83510 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TnikP83510 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TnikP83510 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TnikP83510 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TnikP83510 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TnikP83510 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TnikP83510 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TnikP83510 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TnikP83510 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TnikP83510 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TnikP83510 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TnikP83510 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TnikP83510 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TnikP83510 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TnikP83510 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TnikP83510 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TnikP83510 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TnikP83510 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TnikP83510 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TnikP83510 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TnikP83510 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TnikP83510 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TnikP83510 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TnikP83510 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TnikP83510 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TnikP83510 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TnikP83510 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TnikP83510 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TnikP83510 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TnikP83510 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TnikP83510 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TnikP83510 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TnikP83510 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TnikP83510 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TnikP83510 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TnikP83510 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TnikP83510 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TnikP83510 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TnikP83510 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TnikP83510 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TnikP83510 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TnikP83510 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TnikP83510 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TnikP83510 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TnikP83510 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TnikP83510 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TnikP83510 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TnikP83510 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TnikP83510 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TnikP83510 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TnikP83510 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TnikP83510 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TnikP83510 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TnikP83510 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TnikP83510 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TnikP83510 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TnikP83510 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TnikP83510 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TnikP83510 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TnikP83510 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TnikP83510 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TnikP83510 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TnikP83510 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TnikP83510 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TnikP83510 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TnikP83510 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TnikP83510 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TnikP83510 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TnikP83510 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TnikP83510 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TnikP83510 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TnikP83510 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TnikP83510 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TnikP83510 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TnikP83510 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TnikP83510 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TnikP83510 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TnikP83510 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TnikP83510 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TnikP83510 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TnikP83510 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TnikP83510 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TnikP83510 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TnikP83510 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TnikP83510 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TnikP83510 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TnikP83510 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TnikP83510 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TnikP83510 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms