Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx3P81067 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Irx3P81067 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx3P81067 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx3P81067 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Irx3P81067 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx3P81067 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx3P81067 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx3P81067 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx3P81067 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Irx3P81067 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx3P81067 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms