Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otx2P80206 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx2P80206 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otx2P80206 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx2P80206 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otx2P80206 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx2P80206 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx2P80206 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otx2P80206 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otx2P80206 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otx2P80206 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otx2P80206 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otx2P80206 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx2P80206 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.6 ms