Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufd1P70362 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufd1P70362 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ufd1P70362 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms