Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad1P70340 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad1P70340 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad1P70340 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smad1P70340 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smad1P70340 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad1P70340 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad1P70340 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad1P70340 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad1P70340 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms