Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Cux2P70298 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cux2P70298 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Cux2P70298 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cux2P70298 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cux2P70298 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cux2P70298 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cux2P70298 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
Cux2P70298 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cux2P70298 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cux2P70298 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cux2P70298 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cux2P70298 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Cux2P70298 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Cux2P70298 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cux2P70298 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cux2P70298 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cux2P70298 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms