Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NficP70255 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NficP70255 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NficP70255 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NficP70255 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NficP70255 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NficP70255 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NficP70255 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NficP70255 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NficP70255 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NficP70255 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NficP70255 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NficP70255 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NficP70255 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NficP70255 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NficP70255 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NficP70255 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NficP70255 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NficP70255 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NficP70255 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NficP70255 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NficP70255 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NficP70255 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NficP70255 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NficP70255 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NficP70255 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NficP70255 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NficP70255 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NficP70255 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NficP70255 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NficP70255 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NficP70255 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NficP70255 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NficP70255 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NficP70255 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NficP70255 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NficP70255 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NficP70255 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NficP70255 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NficP70255 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NficP70255 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NficP70255 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NficP70255 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NficP70255 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NficP70255 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NficP70255 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NficP70255 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NficP70255 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NficP70255 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NficP70255 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NficP70255 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NficP70255 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NficP70255 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NficP70255 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NficP70255 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NficP70255 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NficP70255 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NficP70255 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NficP70255 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NficP70255 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NficP70255 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NficP70255 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NficP70255 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NficP70255 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NficP70255 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NficP70255 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NficP70255 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NficP70255 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NficP70255 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NficP70255 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NficP70255 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NficP70255 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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