Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smpdl3aP70158 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3aP70158 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3aP70158 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3aP70158 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpdl3aP70158 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms