Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcbP68404 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PrkcbP68404 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcbP68404 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcbP68404 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcbP68404 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms