Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrb3P63080 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gabrb3P63080 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrb3P63080 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms