Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ElobP62869 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ElobP62869 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ElobP62869 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ElobP62869 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ElobP62869 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ElobP62869 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ElobP62869 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ElobP62869 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ElobP62869 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ElobP62869 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ElobP62869 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ElobP62869 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ElobP62869 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ElobP62869 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ElobP62869 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ElobP62869 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ElobP62869 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ElobP62869 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ElobP62869 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ElobP62869 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ElobP62869 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ElobP62869 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ElobP62869 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ElobP62869 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ElobP62869 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ElobP62869 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ElobP62869 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ElobP62869 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ElobP62869 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ElobP62869 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ElobP62869 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElobP62869 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElobP62869 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElobP62869 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElobP62869 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElobP62869 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElobP62869 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElobP62869 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ElobP62869 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElobP62869 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElobP62869 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ElobP62869 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElobP62869 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElobP62869 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElobP62869 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElobP62869 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElobP62869 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElobP62869 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms