Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpd3P62320 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd3P62320 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms