Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmc5P62196 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmc5P62196 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmc5P62196 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmc5P62196 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmc5P62196 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmc5P62196 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmc5P62196 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmc5P62196 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms