Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrch1P62046 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrch1P62046 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrch1P62046 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms