Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arf3P61205 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf3P61205 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arf3P61205 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf3P61205 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arf3P61205 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf3P61205 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf3P61205 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf3P61205 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf3P61205 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf3P61205 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf3P61205 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf3P61205 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf3P61205 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf3P61205 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf3P61205 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf3P61205 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf3P61205 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arf3P61205 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arf3P61205 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf3P61205 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arf3P61205 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arf3P61205 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf3P61205 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arf3P61205 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arf3P61205 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf3P61205 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms