Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ActbP60710 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ActbP60710 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ActbP60710 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ActbP60710 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ActbP60710 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ActbP60710 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ActbP60710 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ActbP60710 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ActbP60710 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ActbP60710 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ActbP60710 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ActbP60710 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ActbP60710 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ActbP60710 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ActbP60710 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ActbP60710 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ActbP60710 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ActbP60710 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ActbP60710 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ActbP60710 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ActbP60710 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ActbP60710 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ActbP60710 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ActbP60710 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ActbP60710 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ActbP60710 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ActbP60710 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ActbP60710 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ActbP60710 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ActbP60710 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ActbP60710 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ActbP60710 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ActbP60710 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ActbP60710 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ActbP60710 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ActbP60710 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ActbP60710 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ActbP60710 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ActbP60710 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ActbP60710 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ActbP60710 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ActbP60710 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ActbP60710 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ActbP60710 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ActbP60710 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ActbP60710 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ActbP60710 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ActbP60710 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ActbP60710 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ActbP60710 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ActbP60710 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ActbP60710 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ActbP60710 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ActbP60710 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ActbP60710 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ActbP60710 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ActbP60710 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ActbP60710 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ActbP60710 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ActbP60710 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ActbP60710 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ActbP60710 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ActbP60710 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ActbP60710 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ActbP60710 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ActbP60710 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ActbP60710 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ActbP60710 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ActbP60710 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ActbP60710 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ActbP60710 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ActbP60710 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ActbP60710 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ActbP60710 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ActbP60710 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ActbP60710 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ActbP60710 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ActbP60710 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ActbP60710 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ActbP60710 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms