Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcbp1P60335 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcbp1P60335 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp1P60335 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms