Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdo1P60334 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdo1P60334 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdo1P60334 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms