Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup43P59235 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup43P59235 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup43P59235 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nup43P59235 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup43P59235 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup43P59235 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup43P59235 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup43P59235 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup43P59235 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup43P59235 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup43P59235 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup43P59235 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup43P59235 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup43P59235 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms