Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm2P58774 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm2P58774 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm2P58774 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm2P58774 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms