Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd4P58467 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd4P58467 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd4P58467 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd4P58467 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd4P58467 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd4P58467 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd4P58467 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd4P58467 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd4P58467 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd4P58467 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd4P58467 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd4P58467 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd4P58467 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms