Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sssca1P56873 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sssca1P56873 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sssca1P56873 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms