Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd38P56528 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd38P56528 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd38P56528 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd38P56528 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd38P56528 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd38P56528 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd38P56528 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd38P56528 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd38P56528 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd38P56528 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd38P56528 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms