Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GferP56213 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GferP56213 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GferP56213 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GferP56213 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GferP56213 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GferP56213 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GferP56213 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GferP56213 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GferP56213 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GferP56213 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GferP56213 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GferP56213 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GferP56213 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GferP56213 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GferP56213 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GferP56213 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GferP56213 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GferP56213 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GferP56213 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GferP56213 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GferP56213 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GferP56213 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GferP56213 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GferP56213 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GferP56213 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GferP56213 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GferP56213 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GferP56213 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GferP56213 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GferP56213 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GferP56213 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GferP56213 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GferP56213 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GferP56213 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GferP56213 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GferP56213 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GferP56213 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GferP56213 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GferP56213 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GferP56213 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GferP56213 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GferP56213 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GferP56213 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GferP56213 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GferP56213 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GferP56213 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GferP56213 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GferP56213 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GferP56213 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GferP56213 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GferP56213 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GferP56213 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GferP56213 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GferP56213 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GferP56213 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GferP56213 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GferP56213 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GferP56213 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GferP56213 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GferP56213 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GferP56213 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GferP56213 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GferP56213 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GferP56213 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms